后火影时代，大筒木之神矢楳苏醒，对忍界发动强袭！
佐助的挚友，妻子，孩子，弟子，同伴，全部惨死！
在濒死之际，用伊邪纳岐逃生的佐助，在唯二幸存者大蛇丸的协助下，回到过去的时代！
睁开眼睛……是终结之谷的雨幕，月下点亮的万花筒，他怀着和曾经截然不同的心境，毅然迈向分歧点！
既然凡人之躯无法挑战神明，那就成为更加强大的神明吧！
佐助毅然决定，借助大蛇丸毕生积累的成果……化身大筒木，然成为大筒木就足够了吗？且看他如何在至高无上的神明苏醒前，在奇迹之人的协助下，跨越数千年的差距吧！
“只要我们还在，忍者的时代，就永远都不会结束……！”